25 января 1990 г. он вернулся в Азербайджан, застав события, последовавшие за вводом советских войск в Баку. Страна изменилась, и защита докторской диссертации отошла на второй план. Правда, монографию на эту тему в соавторстве с З. Алиевым он все же опубликовал. К лету 1993 г. он завершит докторскую диссертацию на тему «Мораль и политика», но и ее не защитит в связи с участием в событиях вокруг Талыш-Муганской (Автономной) Республики. Но в 1992 г. он опубликовал в соавторстве с Г. Ширалиевым первый в стране учебник по политологии, который был переработан и переиздан в 1993 г.

Начавшаяся в середине 1980-х перестройка привела к резкому изменению национального вопроса как во всем Советском Союзе, так и в Азербайджане в частности. В 1989 г. талыши, фактически исключенные из переписей населения после 1939 г., смогли вновь вернуться в число официально закрепленных народов страны. Важную роль в этом сыграли активисты созданного незадолго до этого в д. Шагласер талышского просветительского общества «Авеста» (Огтай Аскеров (Аскарзода) (председатель общества), Захираддин Ибрагими, Валишах Алиев и др.). После длительного перерыва в самиздате стали появляться талышские газеты.

23 декабря 1989 г. в Баку состоялась учредительная конференция Республиканского центра талышской культуры с участием значительной части талышских ученых и активистов страны. С обретением Азербайджаном независимости «талышское возрождение» лишь усилилось. С 20 февраля 1992 г. стала издаваться газета «Толыши садо» («Голос Талыша») — орган РЦТК. В том же году состоялся учредительный съезд Талышской народной партии (впоследствии она была переименована в Партию равенства народов Азербайджана; председателем партии был избран Гилал Мамедов (Мамедзода)). Ф. Аббасов изначально не был активным участником этих процессов. Но совсем скоро, уже через год он окажется в гуще судьбоносных для талышского народа событий. 1993−2008.

21 июня 1993 г. группа талышских военных во главе с бывшим заместителем министра обороны Азербайджана, создателем Талышского (Ленкоранского) добровольческого батальона Алакрамом Гумматовым (Гумматзода) провозгласили в г. Ланконе (Ленкорани) на территории семи районов страны Талыш-Муганскую Республику. Ф. Аббасов, часто в 1993 г. выступавший в республиканской прессе (газета «Миллят» и др.) с аналитическими материалами, был приглашен на встречу руководства ТМР с представителями талышской интеллигенции из Баку и Сумгаита, которая должна была состояться 4 июля.

 В Ланконе он вскоре возглавил комиссию, которая готовила проект Конституционного закона Талыш-Муганской Республики. По его же инициативе началась подготовка созыва Народного Меджлиса (Парламента) Талыш-Муганской Республики, который должен был передать власть от военных гражданскому правительству. Ф. Аббасов и другие активисты организовали и провели сессии советов народных депутатов районов, вошедших в состав ТМР. На них были отобраны 150 депутатов будущего Народного Меджлиса. Еще 100 депутатов были отобраны из числа местных старейшин. 7 августа в заседании Парламента приняли участие 217 из них. Они приняли временный регламент Народного Меджлиса, провозгласили Талыш-Муганскую Автономную Республику в составе Азербайджанской Республики, а также приняли ее Конституционный закон. Президентом ТМАР был избран Алакрам Гумматов, а председателем Народного Меджлиса — Фахраддин Аббасов. Также депутатами был утвержден флаг ТМАР, обсужден гимн.

Парламент Талыш-Муганской Автономной Республики направил обращение в Парламент Азербайджанской Республики с просьбой утвердить провозглашение ТМАР, но оно осталось без рассмотрения. Также власти новой республики назначили на 29 августа выборы мэра (вали) г. Ланкона. Однако им не суждено было состояться.

Игбал Абилов